Genomică

Semestrul de toamnă

Titular de curs: prof. univ. Barbacar Nicolae, biroul 713, E-mail: [email protected]

Eligibilitatea: program de masterat Biologie, Biologie Moleculară, Ştiinţe ale Mediului (la solicitare).

Pre-rechezit: studii universitare de licenţă Ştiinţe ale naturii.

Structura:    curs teoretic - 30 ore (4 ore săptămânal)

laborator – 15 (2 ore săptămânal)

activităţi individuale  - 105 ore

Activităţi formative

Studenţii ascultă un ciclu de lecţii de sinteză a informaţiei în domeniu care reflectă analiza moleculară a diferitor secvenţe de ADN( secvenţe înalt repetetive, mini- şi microsatelitice, elemente migratoare), procesele de bază  în organizarea moleculară şi funcţională a genomului nuclear, mitocondrial şi al cloroplastelor în scopul cunoaşterii în ansamblu a genomului vegetal şi animal.  În cadrul lecţiilor teoretice şi practice studenţii învaţă să analizeze secvenţele nucleotidice ale genelor stocate în băncile de date genomice. Activităţile individuale planificate includ descrierea şi analiza informaţiei privind specificitatea genomului  la bacterii, drojdii, plante şi om în plan comparativ şi evolutiv care va fi prezentată sub formă de eseu. De asemenea, studenţii vor fi stimulaţi pentru elaborarea unor proiecte de cercetare în domeniu.

Conţinutul cursului

Organizarea moleculară a genomului. Metodele de cercetare. Genomul eucariotelor inferioare (drojdii, fungilor şi alge). Genomul plantelor. Caracteristica moleculară a genomului la  Arabidopsis thaliana. Specificitatea genomului la alte plante (tomate, porumb, grâu, orez, brasica ş.a.). Secvenţele mini- şi microsatelitice de ADN. Secvenţe de ADN moderat repetetive şi caracteristica lor moleculară. Elementele migratoare. Valoarea lor în analiza genomică. Familii de gene. Evoluţia familiilor de gene. Pseudogene şi caracteristica lor în genomul diferitelor organisme. Activitatea  funcţională a genomului. Replicarea, transcripţia şi replicare. Strategii experimentale de analiză a ADN-lui recombinant. Strategii experimentale bazate pe tehnica de PCR. Analiza fragmentelor de ADN cu diferite deleţii, inversii şi translocaţii.

Lista surselor bibliografice obligatorii la curs

ГловерД., Клонирование ДНК.1988. Издательство“Мир”; L. Gavrilă. Genomica. Editura enciclopedică. Bucureşti, 2003; B. Lewin  Genes.1997, 2003. Oxford University Press.; Sambrook. Molecular Cloning 2001. Cold Spring Harbor Laboratory Press; P.Berg. Genes and Genomes. 1991. Oxford University Press; D.Moldoveanu, Costin Militaru, Iulia Moldoveanu. Microbiologie şi Inginerie Genetică; Альберте Б. и др. Молекулярная биология клетки. М.,Мир, 1994 ; Уотсон Д. Молекулярная биология гена. М., Мир, 1978 г.

Evaluarea

Activitatea studentului va fi monitorizată la fiecare tip de activitate şi va fi apreciată prin note. La sfârşitul cursului va avea loc examenul final (180 min., scris ), care va include un test complex de întrebări la nivel de cunoaştere, integrare şi aplicare a cunoştinţelor. Nota finală se va constitui din reuşita academică demonstrată la elaborarea eseului şi la lucrările de control (25%), activităţile individuale în clasa multimedia (25%), aplicaţiile practice în laborator (20%) şi examenul final (30%).

Onestitatea academică

Studenţii sunt  încurajaţi să lucreze în echipă,  să se ajute reciproc în cadrul seminarelor şi activităţilor multimedia, efectuând temele în cadrul activităţilor individuale, însă fiecare temă, activitate sau lucrare prezentată spre evaluare trebuie sa fie una personală. Nu se acceptă plagierea, copierea, utilizarea materialelor din internet, etc.